Интересные факты:
- Двукратная олимпийская чемпионка 2010 года, 12-кратная чемпионка мира (рекорд среди женщин), трёхкратная обладательница Кубка мира (2007/08, 2009/10, 2011/12), обладательница семи малых Кубков мира, трёхкратная чемпионка мира по летнему биатлону. Лучшая спортсменка года в Германии 2007, 2011 и 2012 годов.
- Заниматься горными лыжами она начала в четырёхлетнем возрасте. Позже, будучи участницей лыжного клуба SC Wallgau, пробовала себя в разных зимних видах спорта. В биатлонную секцию Магдалену привели родители в возрасте девяти лет, где ей сразу же очень понравилось.
- Увлекается вязанием, ведет блог, посвящённый вязанию. Также она увлекается музыкой (игрой на арфе).
- В феврале 2007 года Нойнер отвергла предложение журнала Playboy. В июне 2010 года Магдалена приняла участие в рекламной кампании нижнего белья марки Mey.
- В декабре 2009 Нойнер сообщила о своих романтических отношениях с Йозефом Хольцером (Josef Holzer), бывшим школьным другом. Йозеф — простой плотник, живёт в Вальгау. 29 марта 2014 года вышла за него замуж.